Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms