Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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