Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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