Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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