Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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