Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms