Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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