Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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USP18Q9UMW8 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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