Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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NDUFA9Q16795 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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NDUFA9Q16795 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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NDUFA9Q16795 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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NDUFA9Q16795 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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