Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FSCN1Q16658 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms