Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LAX1-203ENST00000442561 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC02059-202ENST00000506471 2094 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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