Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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