Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TTPAP49638 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TTPAP49638 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TTPAP49638 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TTPAP49638 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TTPAP49638 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TTPAP49638 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TTPAP49638 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
TTPAP49638 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TTPAP49638 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TTPAP49638 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms