Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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CLDN9O95484 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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