Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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