Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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