Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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