Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
SS18Q15532 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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