Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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