Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 TNFRSF10D-201ENST00000312584 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 C6orf222-201ENST00000437635 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 AC098850.4-201ENST00000448331 8802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 VPS4A-201ENST00000254950 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 IGLV3-27-201ENST00000390304 377 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 KRTAP8-3P-201ENST00000423658 188 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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