Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CEP290O15078 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CEP290O15078 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms