Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NTRK2Q16620 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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