Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 HSP90B2P-201ENST00000559111 2384 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC005722.2-201ENST00000577087 3370 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 PPP4R1L-207ENST00000493688 2325 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 PAQR5-205ENST00000561153 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LINC01687-202ENST00000419467 465 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 FAM95B1-204ENST00000586273 798 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 FAM95B1-207ENST00000589112 768 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SMG6-IT1-201ENST00000624930 374 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SCN5A-204ENST00000414099 8303 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 HDAC9-228ENST00000524023 2199 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TPTE-204ENST00000618007 2150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 PIK3R4-201ENST00000356763 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 MIR4290HG-201ENST00000426593 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RALYL-205ENST00000521268 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 FZD6-201ENST00000358755 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DCAF8L2-202ENST00000451261 2295 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ZNF620-201ENST00000314529 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DYRK4-211ENST00000540757 3272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SFTPA1-201ENST00000398636 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL136115.3-201ENST00000641788 1873 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TMC3-202ENST00000558726 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ACTRT1-201ENST00000371124 1437 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ZNF655-204ENST00000394163 4528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 NWD1-204ENST00000524140 7641 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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