Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NR1I3-226ENST00000508740 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms