Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRHQ9HD43 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms