Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms