Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms