Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms