Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms