Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PDCD1Q15116 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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