Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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COL4A6Q14031 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL4A6Q14031 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL4A6Q14031 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL4A6Q14031 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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