Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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