Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MIR4518-201ENST00000580665 83 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC099753.1-201ENST00000634947 2118 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AMPH-202ENST00000356264 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PLCH1-204ENST00000460012 6413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TRIM16-202ENST00000416464 3184 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 C16orf62-205ENST00000513947 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SCNN1G-201ENST00000300061 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CD59-203ENST00000415002 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MCTP1-201ENST00000312216 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ASTE1-201ENST00000264992 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC090079.1-201ENST00000572092 1183 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL031772.1-216ENST00000619494 697 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RBMS3-AS2-207ENST00000629416 456 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZSCAN5B-201ENST00000358992 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 NDUFB5-214ENST00000493866 4046 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL513548.3-201ENST00000611708 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GOLGA8B-201ENST00000342314 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC128688.2-201ENST00000563632 1937 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC009403.2-202ENST00000636307 3956 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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