Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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IFT88Q13099 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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