Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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