Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PIK3CBP42338 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PIK3CBP42338 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PIK3CBP42338 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PIK3CBP42338 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PIK3CBP42338 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PIK3CBP42338 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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