Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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PKHD1P08F94 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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PKHD1P08F94 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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