Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTNNA3Q9UI47 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms