Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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