Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PTCH1Q13635 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PTCH1Q13635 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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PTCH1Q13635 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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PTCH1Q13635 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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PTCH1Q13635 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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