Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms