Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NME3Q13232 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NME3Q13232 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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