Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AGTPBP1-202ENST00000357081 4393 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TRIM6-212ENST00000621176 3005 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 BBS12-201ENST00000314218 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
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