Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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