Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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RNF17Q9BXT8 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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RNF17Q9BXT8 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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RNF17Q9BXT8 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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RNF17Q9BXT8 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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RNF17Q9BXT8 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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RNF17Q9BXT8 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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RNF17Q9BXT8 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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