Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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