Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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HERC1Q15751 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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HERC1Q15751 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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