Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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