Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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