Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SCOC-AS1-201ENST00000512692 1987 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LINC00927-203ENST00000558913 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SYNE1-217ENST00000466159 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC113554.1-201ENST00000606284 490 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 KRT7-214ENST00000638501 398 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms